根据研究方向，目前研究所分为9个研究方向，分别是航天器动力学与控制、飞行器制导与控制系统、飞行器总体结构与控制、飞行器电动伺服系统、飞控计算机与电气系统、精确制导与半实物仿真、飞行控制与数字仿真、飞行器先进控制理论、空间监测与图像处理。